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Annonce de webinaire – Suivi haute-fréquence de la température des plans d’eau en France – 5 décembre 2025
Participez le vendredi 5 décembre 2025 au webinaire sur le suivi de la température des plans d’eau à haute-fréquence🌡️Lien d'inscription🌡️Le webinaire se tiendra entre 13h30 et 16h30 le 5 décembre 2025 (programme en bas de page).  Un lien de connexion sera partagé aux inscrits quelques jours auparavant.Tendances long-terme : Réchauffement des plans d'eau du territoire mis en évidence par des travaux de modélisation (Sharaf et al, 2023)Les plans d’eau sont des écosystèmes particuliers qui rendent nombreux services écosystémiques (réserve et refuge de biodiversité, ressource en eau potable, production hydroélectrique, tourisme, pêche, etc.). Leur fonctionnement et leur état est étroitement lié au climat et aux activités anthropiques. Dans un contexte de changement climatique, il est essentiel de pouvoir caractériser la réponse des plans d’eau (amplitude, direction) afin d'anticiper leur trajectoire.La température est un paramètre clé fortement corrélé au fonctionnement (stratification, brassage) et à la disponibilité en habitats (températures seuils, solubilité de l’oxygène) des plans d’eau. Il s’agit d’une donnée de base pour les gestionnaires et les scientifiques pour comprendre l’état d’une masse d’eau.Le Réseau National de suivi de la Température des plans d’eau (RNT plans d’eau) a pour ambition de fournir des données de qualité à haute-fréquence pour caractériser la trajectoire thermique des plans d’eau face au changement climatique. Le RNT plans d’eau est animé par le Pôle R&D ECLA et réunit des acteurs variés de la gestion et de la connaissance des écosystèmes lacustres. Le vendredi 5 décembre 2025, le Pôle R&D ECLA organise un webinaire sur le suivi de la température des plans d’eau à haute-fréquence. Au programme : Rappel des objectifs du Réseau National de suivi de la Température des plans d’eau (RNT plans d’eau), Présentation du protocole de suivi in-situ, Exposé du travail en cours autour de la gestion des données (dépôt, contrôle, sécurisation et accès),Échanges entre producteurs de données sur les prochaines étapes pour améliorer le partage d’outils et de connaissances.Au-delà des ambitions propres du réseau, le Pôle R&D ECLA propose à toute structure ou réseau en charge de suivis d’utiliser les outils développés pour le RNT plans d’eau. Ainsi, toute personne intéressée par des informations sur le suivi haute-fréquence des plans d'eau et/ou volontaire pour contribuer à une dynamique nationale autour de ces questions, est invitée à s'inscrire au séminaire.🌡️Lien d'inscription🌡️ Pourquoi participer ?L’acquisition de données in situ à haute-fréquence représente une avancée majeure pour la caractérisation de la dynamique des écosystèmes lacustres, et leur réponse aux changements climatiques (réchauffement, événements extrêmes). Les enjeux de suivi, stockage, validation, sécurisation et interprétation des données rencontrés sont partagés par toute structure responsable d’un suivi, ou avec la volonté d’en initier.💡 Les outils et solutions sur lesquelles nous travaillons ont vocation à être mis à disposition de la communauté. Venez vous renseigner et évaluer si une synergie plus large autour du suivi haute-fréquence des plans d’eau est possible entre nos réseaux. Programme Organisation et intervenants : Rosalie Bruel, Tiphaine Péroux, Nathalie Reynaud, Thierry Tormos, Julien Roes.Modalité de connexion : un lien zoom sera partagé quelques jours avant le webinaire.Session 1 : Contexte et protocoles de suivi de la température13h30 – Accueil et présentation des objectifs du séminaire 13h45 – Le suivi de la température en France  Pourquoi suivre la température des plans d'eau ? Brève historique et présentation des résultats du recensement 2024 sur les acteurs producteurs de données.14h05 – Rappel sur le protocole RNT  Différentes configurations d’équipement de plan d’eau —protocole du RNT plans d'eau 🔗 (plan d’eau naturel non marnant, plan d’eau en Espace Naturel Protégé, risque de vandalisme, petit étang, etc.) — et les bons réflexes à avoir (programmation capteurs, etc.). 14h20 - Questions Session 2 : Gestion des données14h30 – Anticiper la bancarisation Les prérequis pour une bonne bancarisation : Nom de station, profondeur, création de stations, interlocuteur SANDRE, etc.14h40 – Validation des données : LAQ, présentation de l’application (point de vue utilisateur) Liste des fonctionnalités et démonstration.15h05 – Sécurisation des données : présentation de la bd-thermieComprendre les liens entre ce qui a été demandé dans l’application de bancarisation et ce que stocke la base de données.Comprendre les choix sur la base de données (SANDRIFication).Modalités d’accès à cette donnée (e.g., prévoir une vue par réseau pour l'accès).15h15 – Accès aux données Depuis la base de donnéesDepuis le geo ecla et le dashboard thermie 15h30 – Temps d’échanges L'opportunité de discuter des prochaines étapes : sélection de nouveaux plans d'eau à équiper, intégrer des données existantes à la base de données, calculs d'indicateurs.16h30 – Fin du webinaireVariations inter-annuelles : Moyennes annuelles de température des couches 0,5-15 m, 15-30 m, et 30-60,5 m sur le lac de Sainte-Croix (04) suivi dans le cadre du RNT plans d'eau. Variations intra-annuelles : Le suivi en continu (et le long de la colonne d'eau pour les plans d'eau les plus profonds) permet de caractériser finement la réponse thermique du plan d'eau en fonction de la météo. Ici, la température mesurée par le dispositif du lac de Sainte-Croix (04) en 2018, 2021 et 2022. En été, la surface se réchauffe et des températures records ont été enregistrées en 2022 dans la couche de surface.             Pour plus d’informations sur le RNT plans d’eau : https://poleecla.fr/reseau/thermie  
Publié par Rosalie Bruel le 20/11/2025.
Appel à données zooplancton pour les plans d’eau français
Dans le cadre du projet CLIMEULAC, s’inscrivant au sein du Pôle R&D ECLA, un appel à contributions pour recueillir des données sur le zooplancton des plans d’eau français est lancé. L'objectif est de mieux comprendre les effets combinés de la température et des nutriments sur la biodiversité lacustre, en reconstituant les réseaux trophiques à partir de 4 compartiments biologiques suivants : phytoplancton, zooplancton, macro-invertébrés et poissons.Le zooplancton, bien que central dans les chaînes alimentaires aquatiques, est encore peu documenté dans les suivis réglementaires (ex. DCE). C’est pourquoi cet appel à contribution est lancé. Venez partager dans le cadre de ce projet vos données existantes. Comment contribuer ?Deux options s’offrent à vous :Option 1 - Compléter un tableur structuréFichier au format standardisé français et anglais avec onglets pour les auteurs, les plans d’eau, les stations d’échantillonnage et les données d’abondance/taxonomieUn fichier exemple rempli est également fourni pour vous guider au formatageTélécharger et remplir en priorité les onglets de couleur verte (les autres si possible)Renvoyer le fichier par email à tom.reveillon@inrae.fr et arnaud.sentis@inrae.frLien vers le fichier contenant les fichiers ici. Ce dossier contient les fichier ZOO_modele et ZOO_exemple en français et en anglais.Option 2 - Transmettre vos données brutesDe préférence accompagnées d’un onglet décrivant la structure et les métadonnéesIl est conseillé de consulter le tableur standardisé pour vous assurer que les informations clés y figurent A quoi serviront vos données ?Les données alimenteront une base nationale sur la biodiversité fonctionnelle et structurelle des lacs, couvrant un large gradient environnemental. Elles seront utilisées pour :Reconstruire les réseaux trophiques lacustres complexes ;Analyser les réponses des communautés au changement global ;Publier des travaux scientifiques collaboratifs. Quels retours pour les contributeurs ?En contrepartie de votre participation, il vous est proposé :Un accès prioritaire à la base de données taxonomique et fonctionnelle complète ;Une possibilité de co-autorat sur les publications scientifiques issues de vos données ;Un retour individualisé sur votre ou vos plans d’eau : comparaison aux tendances nationales, positionnement écologique ou autre.Merci pour votre contribution à ce projet collectif. Pour toute question ou aide au formatage des données, n'hésitez pas à contacter : tom.reveillon@inrae.fr et arnaud.sentis@inrae.frTom Réveillon, Christine Argillier, Martin Daufresne, Victor Frossard, Christophe Laplace-Treyture, Nathalie Reynaud, Serena Rasconi, Rosalie Bruel et Arnaud Sentis
Publié par Tom REVEILLON et Arnaud SENTIS le 03/07/2025.
Le Carrtel propose un poste de post-doc à partir de novembre 2022 en metabarcoding ADN du phytoplancton
Offre post-doc en  metabarcoding ADN : écologie microbienne et des diatomées.- Contrat de 2 ans en post-doc à partir de novembre 2022. La date de début est flexible, mais doit être avant janvier 2023.- Vous travaillerez dans le cadre d'un projet Horizon Europe.- Vous analyserez de grands ensembles de données de metabarcoding provenant de lacs et de rivières pour différents micro-organismes (diatomées, diversité microbienne). - Vous participerez également à des formations pour le transfert de connaissances (eDNA). Nous recherchons de bonnes compétences en écologie moléculaire et microbienne.- Votre lieu de travail : au bord du lac Léman en France : UMR Carrtel, Thonon les Bains, FrancePlus de détails : https://www6.lyon-grenoble.inrae.fr/carrtel/Research-opportunities/Opportunities/Post-Doc-Offer-DNA-metabarcoding-microbial-and-diatom-ecology---Post-Doc Offer: DNA metabarcoding : microbial and diatom ecology-  2 years contract in post-doc from November 2022. Start date is flexible, but must be before January 2023.-  You will work in the framework of a Twinning Horizon Europe project-  You will analyze large metabarcoding datasets from lakes and rivers for different microorganisms (diatoms, full microbial diversity).-  You will also participate to training courses for knowledge transfer (eDNA). We’re looking for good skills in molecular and microbial ecology.-  Your work place: on Lake Geneva shore in France : UMR Carrtel, Thonon les Bains, FranceMore details: https://www6.lyon-grenoble.inrae.fr/carrtel/Research-opportunities/Opportunities/Post-Doc-Offer-DNA-metabarcoding-microbial-and-diatom-ecology
Publié par Pôle ECLA le 10/02/2023.