Historiquement, le Pôle ECLA a eu la responsabilité de rassembler et administrer l'ensemble des données issues des suivis réglementaires sur les plans d'eau pour les différents compartiments biologiques (ichtyofaune, macroinvertébrés, macrophytes, phytoplancton, diatomées), la physico-chimie, ainsi que les conditions physiques et environnementales.
Depuis 2017, cette tâche incombe désormais majoritairement aux Agences de l'eau, responsables de la gestion et de la diffusion des données réglementaires sur leurs bassins respectifs, à l'exception des données concernant l’ichtyofaune, l’hydromorphologie et la température qui restent à la charge du Pôle.
Ces données sont centralisées au niveau national et progressivement mises à disposition via le Portail NAIADES dédié aux données sur la qualité des eaux de surface.